在神經細胞中SNAREs負責突觸小泡的停泊和融合，破傷風毒素和肉毒素等細菌分泌的神經性毒素實際上是一類特殊的蛋白酶，能夠選擇性地降解SNAREs，從而阻斷神經傳導。

精卵的融合、成肌細胞的融合均涉及SNAREs，另外病毒融合蛋白的工作原理與SNAREs相似，介導病毒與宿主質膜的融合